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NFDI ToolTalk: One roof, several services: Bringing together all DataPLANT efforts
NFDI ToolTalk: One roof, several services: Bringing together all DataPLANT efforts
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Description Slides of the presentation given on June 08, 2022 as part of the NFDI ToolTalk series. The presentation follows up on the status reached after one and a half year into DataPLANT services discussions and developments. It will show the general concept and the already implemented services and how they could fit into either local or centralized research infrastructures. In the future these services may run on-top of future NFDI base services or integrate NFDI base service components like AAI. DataPLANT services might as well be offered to a wider community beyond fundamental plant research.

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DAPHNE4NFDI. DAta from PHoton and Neutron Experiments
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DAPHNE4NFDI. DAta from PHoton and Neutron ExperimentsDAPHNE4NFDI is the first (inter-)national attempt to bring together users and large-scale research facilities to create a comprehensive infrastructure to process research DAta from PHoton and Neutron Experiments (DAPHNE) according to the FAIR principles. Our community faces a common need for high-level, rapid data analysis and the challenge of implementing research data management for increasingly large and complex datasets. All this involves not only a broad range of scientific disciplines and stakeholders, but also the connection to complex instrumentation and IT. Within the talk, Lisa Amelung would like to inform about the DAPHNE4NFDI consortium and discuss (current) challenges and future tasks.
File Format
PDF
Languages
English
Media Type
Presentation
Publication Date
2022-11-18
License
CCBY
Size
4.9 MB
Authors
Keywords
#NFDI#RDM#Metadaten#metadata#Forschungsdatenmanagement#research data management#research data#Nationale Forschungsdateninfrastruktur#Forschungsdaten#data analysis#FAIR-Prinzipien#DAPHNE4NFDI#FDM#FAIR data#Infrastructure#Datenanalyse#FAIR principles#FAIRe Daten#Infrastruktur#Metadatenerfassung#National Research Data#Neutronenforschung#Photonenforschung#metadata capture#neutron research#photon research
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Chemotion ELN Erklärvideos
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Chemotion ELN ErklärvideosChemotion ELN Erklärvideos Chemotion[1] ist ein Open-Source-System für die Speicherung und Verwaltung von Experimenten und Moleküldaten in der Chemie und deren angrenzenden Wissenschaften. Dabei besteht das System hauptsächlich aus zwei Komponenten: dem elektronischen Laborjournal (electronic laboratory notebook, ELN) Chemotion ELN[2] zur Eintragung und Auswertung von Experimenten und deren Analytik-Daten und dem Chemotion-Repositorium[3,4] zur Veröffentlichung dieser. Durch die Verknüpfung des ELNs mit dem Repositorium können Einträge einfach aus dem Laborbuch transferiert werden. Daten werden inklusive ihrer maschinenlesbaren Metadaten in dem Repositorium unter Open-Access-Bedingungen veröffentlicht und erfüllen somit die FAIR-Data-Prinzipien (findable, accessible, interoperable, reusable).[5] Diese dienen als Grundlage für nachhaltiges Datenmanagement im Rahmen der guten wissenschaftlichen Praxis.[6] Zur Nutzung von Chemotion und zur Erläuterung der grundlegenden Funktionen haben wir Erklärvideos erstellt, die Neulingen den Einstieg in das ELN erleichtern sollen. Diese Videos umfassen wichtige Themen von der Erstellung von Molekülen, über die Auswertung von Analytik-Daten, bis hin zum Teilen von Einträgen. Die Videos sind dabei in verschiedene Themenblöcke aufgeteilt und befassen sich jeweils mit konkreten Funktionen. Die Struktur der Themenblöcke und Videos können dem PDF-Dokument in diesem Zenodo-Eintrag entnommen werden. Wir bitten zu beachten, dass grau hinterlegte Videos in diesem Dokument erst in späteren Versionen des Eintrags zur Verfügung stehen werden. Chemotion ELN Erklärvideos auf YouTube Die Erklärvideos gibt es zusätzlich auch auf Chemotions YouTube Channel: https://www.youtube.com/playlist?list=PL1AonKd9WAd8n8YPXxMaGLQ5ad8PdR3OC Danksagung Die Autoren danken Nicole Jung für weiterführende Erklärungen zu den Funktionen von Chemotion und die Hilfe bei der Erstellung und Überarbeitung der Videos. Weiterhin danken die Autoren Anna Manukânc für die Hilfe bei der konzeptionellen Entwicklung der Videos. Literatur [1] Chemotion. https://chemotion.net/ (accessed 02/19/2023). [2] Tremouilhac, P., Nguyen, A., Huang, Y.-C., Kotov, S., Lütjohann, D. S., Hübsch, F., Jung, N., Bräse, S., J. Cheminform. 2017, 9, 54. [3] Tremouilhac, P., Lin, C.-L., Huang, P.-C., Huang, Y.-C., Nguyen, A., Jung, N., Bach, F., Ulrich, R., Neumair, B., Streit, A., Bräse, S., Angew. Chem. Int. Ed. 2020, 59, 22771-22778; Angew. Chem. 2020, 132, 22960-22968. [4] Tremouilhac, P., Huang, P.-C., Lin, C.-L., Huang, Y.-C., Nguyen, A., Jung, N., Bach, F., Bräse, S., Chemistry–Methods 2021, 1, 8-11. [5] Wilkinson, M. D., Dumontier, M., Aalbersberg, I. J., Appleton, G., Axton, M., Baak, A., Blomberg, N., Boiten, J.-W., da Silva Santos, L. B., Bourne, P. E., Bouwman, J., Brookes, A. J., Clark, T., Crosas, M., Dillo, I., Dumon, O., Edmunds, S., Evelo, C. T., Finkers, R., Gonzalez-Beltran, A., Gray, A. J. G., Groth, P., Goble, C., Grethe, J. S., Heringa, J., ’t Hoen, P. A. C., Hooft, R., Kuhn, T., Kok, R., Kok, J., Lusher, S. J., Martone, M. E., Mons, A., Packer, A. L., Persson, B., Rocca-Serra, P., Roos, M., van Schaik, R., Sansone, S.-A., Schultes, E., Sengstag, T., Slater, T., Strawn, G., Swertz, M. A., Thompson, M., van der Lei, J., van Mulligen, E., Velterop, J., Waagmeester, A., Wittenburg, P., Wolstencroft, K., Zhao, J., Mons, B., Sci. Data 2016, 3, 160018. [6] Deutsche Forschungsgemeinschaft. Guidelines for Safeguarding Good Research Practice. Code of Conduct. 2019, https://doi.org/10.5281/zenodo.3923602 [Titel anhand dieser DOI in Citavi-Projekt übernehmen] . Nützliche Links Chemotion. https://chemotion.net/ (accessed 02/19/2023). Chemotion ELN Documentation. https://chemotion.net/docs/eln/ (accessed 02/19/2023). Chemotion Repository. https://www.chemotion-repository.net/welcome (accessed 03/14/2022). Molecule Archive of the Compound Platform. https://compound-platform.eu/home (accessed 03/14/2022).
Learning Resource Type
Tutorial
File Format
MP4
Languages
German
Media Type
Video
Publication Date
2023-02-15
License
CCBY
Size
677.1 MB
Authors
Keywords
#NFDI#Forschungsdatenmanagement#Research Data Management#NFDI4Chem#ELN#Electronic Laboratory Notebook#Chemotion#Chemotion ELN#Chemotion Repository#Digitalization#Instruction Videos#Teaching
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NFDI4Ing Community Meeting CC-42 2022: Überblick zu NFDI & NFDI4Ing
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NFDI4Ing Community Meeting CC-42 2022: Überblick zu NFDI & NFDI4IngEine kurze Einführung in die Nationale Forschungsdateninfrastruktur (NFDI)und die Nationale Forschungsdateninfrastruktur für Ingenieure (NFDI4Ing). A short introduction to the (German) National Research Data Infrastructure (NFDI) and the National Research Data Infrastructure for Engineers (NFDI4Ing).
File Format
Unknown
Languages
German
Media Type
Video
Publication Date
2022
License
CCBY
Authors
Keywords
#NFDI#RDM#Forschungsdatenmanagement#Nationale Forschungsdateninfrastruktur#FDM#Research Data Management#NFDI4Ing
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Presentation at Analytica conference 2022: Chemotion ELN and Chemotion Repository as tools for the digitalization in chemical research within the framework of NFDI4Chem
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Presentation at Analytica conference 2022: Chemotion ELN and Chemotion Repository as tools for the digitalization in chemical research within the framework of NFDI4ChemPresentation given at the Analytica conference 2022 in Munich taking place from June 21st to June 23rd. The presentation entitled "Chemotion ELN and Chemotion Repository as tools for the digitalization in chemical research within the framework of NFDI4Chem" was part of the session "Research Data Management III" organized by the German Chemical Society (GDCh).
File Format
PDF
Languages
English
Media Type
Presentation
Publication Date
2022-06-28
License
CCBY
Size
5.5 MB
Authors
Keywords
#NFDI#FAIR data#Research Data Management#NFDI4Chem#ELN#Electronic Laboratory Notebook#Chemotion#Chemotion ELN#Chemotion Repository#Digitalization#Standards#Analytica 2022#Analytica conference 2022#Chemistry#Teaching RDM
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Was sind Normdaten?
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Was sind Normdaten?Das Tutorial erklärt grundsätzlich, was Normdaten sind und wie sie im Bezug auf Forschungsdaten genutzt werden können. Zudem werden Normdaten für verschiedene Entitäten und von verschiedenen Anbietern thematisiert und ihr Potential für das Semantic Web erläutert.
File Format
Unknown
Languages
German
Media Type
Video
Publication Date
2023
License
CCBY
Authors
Keywords
#NFDI#Nationale Forschungsdateninfrastruktur#Forschungsdaten#Standards#FAIR#Culture#Normdaten
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FAIR Data Infrastructure for Agrosystems
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FAIR Data Infrastructure for AgrosystemsThe consortium FAIRagro (launched 2023) focuses on the domain of agrosystem research to enable researchers a FAIR and quality-assured research data management (RDM) to generate, publish and access relevant data, innovative RDM services and modern data science methods to support and advance our community. This Poster was shown at the CoRDI conference 2023 in Karlsruhe (booth poster)
Learning Resource Type
Poster
File Format
PDF
Languages
English
Media Type
Image
Publication Date
2023-11-22
License
CCBY
Size
1.4 MB
Authors
Keywords
#NFDI#Research Data Management#agriculture#Agrosystems
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Data
Literacy
Alliance
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