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DAPHNE4NFDI. DAta from PHoton and Neutron Experiments
DAPHNE4NFDI. DAta from PHoton and Neutron Experiments
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DAPHNE4NFDI is the first (inter-)national attempt to bring together users and large-scale research facilities to create a comprehensive infrastructure to process research DAta from PHoton and Neutron Experiments (DAPHNE) according to the FAIR principles. Our community faces a common need for high-level, rapid data analysis and the challenge of implementing research data management for increasingly large and complex datasets. All this involves not only a broad range of scientific disciplines and stakeholders, but also the connection to complex instrumentation and IT. Within the talk, Lisa Amelung would like to inform about the DAPHNE4NFDI consortium and discuss (current) challenges and future tasks.
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URL: https://zenodo.org/records/7414563Communities:
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Chemotion ELN Erklärvideos
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Chemotion ELN ErklärvideosChemotion ELN Erklärvideos Chemotion[1] ist ein Open-Source-System für die Speicherung und Verwaltung von Experimenten und Moleküldaten in der Chemie und deren angrenzenden Wissenschaften. Dabei besteht das System hauptsächlich aus zwei Komponenten: dem elektronischen Laborjournal (electronic laboratory notebook, ELN) Chemotion ELN[2] zur Eintragung und Auswertung von Experimenten und deren Analytik-Daten und dem Chemotion-Repositorium[3,4] zur Veröffentlichung dieser. Durch die Verknüpfung des ELNs mit dem Repositorium können Einträge einfach aus dem Laborbuch transferiert werden. Daten werden inklusive ihrer maschinenlesbaren Metadaten in dem Repositorium unter Open-Access-Bedingungen veröffentlicht und erfüllen somit die FAIR-Data-Prinzipien (findable, accessible, interoperable, reusable).[5] Diese dienen als Grundlage für nachhaltiges Datenmanagement im Rahmen der guten wissenschaftlichen Praxis.[6] Zur Nutzung von Chemotion und zur Erläuterung der grundlegenden Funktionen haben wir Erklärvideos erstellt, die Neulingen den Einstieg in das ELN erleichtern sollen. Diese Videos umfassen wichtige Themen von der Erstellung von Molekülen, über die Auswertung von Analytik-Daten, bis hin zum Teilen von Einträgen. Die Videos sind dabei in verschiedene Themenblöcke aufgeteilt und befassen sich jeweils mit konkreten Funktionen. Die Struktur der Themenblöcke und Videos können dem PDF-Dokument in diesem Zenodo-Eintrag entnommen werden. Wir bitten zu beachten, dass grau hinterlegte Videos in diesem Dokument erst in späteren Versionen des Eintrags zur Verfügung stehen werden. Chemotion ELN Erklärvideos auf YouTube Die Erklärvideos gibt es zusätzlich auch auf Chemotions YouTube Channel: https://www.youtube.com/playlist?list=PL1AonKd9WAd8n8YPXxMaGLQ5ad8PdR3OC Danksagung Die Autoren danken Nicole Jung für weiterführende Erklärungen zu den Funktionen von Chemotion und die Hilfe bei der Erstellung und Überarbeitung der Videos. Weiterhin danken die Autoren Anna Manukânc für die Hilfe bei der konzeptionellen Entwicklung der Videos. Literatur [1] Chemotion. https://chemotion.net/ (accessed 02/19/2023). [2] Tremouilhac, P., Nguyen, A., Huang, Y.-C., Kotov, S., Lütjohann, D. S., Hübsch, F., Jung, N., Bräse, S., J. Cheminform. 2017, 9, 54. [3] Tremouilhac, P., Lin, C.-L., Huang, P.-C., Huang, Y.-C., Nguyen, A., Jung, N., Bach, F., Ulrich, R., Neumair, B., Streit, A., Bräse, S., Angew. Chem. Int. Ed. 2020, 59, 22771-22778; Angew. Chem. 2020, 132, 22960-22968. [4] Tremouilhac, P., Huang, P.-C., Lin, C.-L., Huang, Y.-C., Nguyen, A., Jung, N., Bach, F., Bräse, S., Chemistry–Methods 2021, 1, 8-11. [5] Wilkinson, M. D., Dumontier, M., Aalbersberg, I. J., Appleton, G., Axton, M., Baak, A., Blomberg, N., Boiten, J.-W., da Silva Santos, L. B., Bourne, P. E., Bouwman, J., Brookes, A. J., Clark, T., Crosas, M., Dillo, I., Dumon, O., Edmunds, S., Evelo, C. T., Finkers, R., Gonzalez-Beltran, A., Gray, A. J. G., Groth, P., Goble, C., Grethe, J. S., Heringa, J., ’t Hoen, P. A. C., Hooft, R., Kuhn, T., Kok, R., Kok, J., Lusher, S. J., Martone, M. E., Mons, A., Packer, A. L., Persson, B., Rocca-Serra, P., Roos, M., van Schaik, R., Sansone, S.-A., Schultes, E., Sengstag, T., Slater, T., Strawn, G., Swertz, M. A., Thompson, M., van der Lei, J., van Mulligen, E., Velterop, J., Waagmeester, A., Wittenburg, P., Wolstencroft, K., Zhao, J., Mons, B., Sci. Data 2016, 3, 160018. [6] Deutsche Forschungsgemeinschaft. Guidelines for Safeguarding Good Research Practice. Code of Conduct. 2019, https://doi.org/10.5281/zenodo.3923602 [Titel anhand dieser DOI in Citavi-Projekt übernehmen] . Nützliche Links Chemotion. https://chemotion.net/ (accessed 02/19/2023). Chemotion ELN Documentation. https://chemotion.net/docs/eln/ (accessed 02/19/2023). Chemotion Repository. https://www.chemotion-repository.net/welcome (accessed 03/14/2022). Molecule Archive of the Compound Platform. https://compound-platform.eu/home (accessed 03/14/2022).
Learning Resource Type
Tutorial
File Format
MP4
Languages
German
Media Type
Video
Publication Date
2023-02-15
License
CCBY
Size
677.1 MB
Authors
Keywords
#Research Data Management#NFDI#Forschungsdatenmanagement#NFDI4Chem#ELN#Electronic Laboratory Notebook#Chemotion#Chemotion ELN#Chemotion Repository#Digitalization#Instruction Videos#Teaching
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Train-the-Trainer-Konzept zum Thema Forschungsdatenmanagement
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Train-the-Trainer-Konzept zum Thema ForschungsdatenmanagementIm Rahmen des BMBF-Projekts FDMentor wurde ein deutschsprachiges Train-the-Trainer-Programm zum Thema Forschungsdatenmanagement (FDM) erstellt, das nach Projektende durch Mitglieder der UAG Schulungen/Fortbildungen der DINI/nestor-AG Forschungsdaten fortlaufend ergänzt und aktualisiert wird. Die behandelten Themen umfassen sowohl die inhaltlichen Aspekte des Forschungsdatenmanagements als auch Einheiten zu didaktischen Grundlagen, zur Entwicklung von Lehr- und Workshopkonzepten. Darüber hinaus enthält das Konzept eine Sammlung didaktischer Methoden. Für die nun veröffentlichte fünfte Version des Train-the-Trainer-Konzepts wurden die Inhalte im Sinne einer nachhaltigeren Nachnutzbarkeit in Latex überführt und um ein neues Design ergänzt. Zu jeder Einheit sind Vorschläge für Umsetzungsmöglichkeiten und den Einsatz didaktischer Methoden sowohl für Präsenz- als auch für Onlineveranstaltungen integriert. Diese wurden durch Nutzung eines Farbschemas besser erfassbar gemacht. Interaktive Infoboxen fassen die zu den einzelnen Einheiten gehörenden Materialien (Präsentationsfolien, Arbeitsmaterialien) zusammen. Das Train-the-Trainer-Konzept steht als pdf zum Download zur Verfügung. Im Ordner Begleitmaterialien befinden sich sowohl die Präsentationsfolien durchführbar als Tag 1 und Tag 2 sowie separiert in einzelne Einheiten als pptx und pdf, als auch Arbeitsmaterialien wie Arbeitsblätter oder Handouts zum Bearbeiten in docx und zum direkten Ausdrucken als pdf. Die Lehrdrehbücher der einzelnen Einheiten wurden aktualisiert und um interaktive Elemente ergänzt. Für jede Einheit ist ein Lehrdrehbuch als pdf vorhanden, das alle wesentlichen Informationen enthält. Zusätzlich wird ein Gesamtlehrdrehbuch für alle Einheiten (Präsenz- und Online-Workshop) als bearbeitbare xlsx zur Verfügung gestellt, in dem nach bestimmten Einheiten und Formaten gefiltert werden kann. Alle Einheiten für die Version 5.0 wurden auf ihre Aktualität hin überprüft sowie einzelne Einheiten inhaltlich auf den neusten Stand gebracht. Die zu Beginn jeder Einheit angegebenen Lernziele wurden in Anlehnung an die Lernzielmatrix zum Themenbereich FDM (DOI: 10.5281/zenodo.8010617) aktualisiert. Zusätzlich zu dieser Version werden Erweiterungsmodule zu den Themen CARE-Prinzipien (DOI: 10.5281/zenodo.10197070), FAIR-Prinzipien (DOI: 10.5281/zenodo.10197079), Elektronisches Laborbuch (DOI: 10.5281/zenodo.10197096), Nachnutzung von Forschungsdaten (DOI: 10.5281/zenodo.10160865) und Softwaremanagementplan (DOI: 10.5281/zenodo.10197107) publiziert. Es ist geplant, weitere thematische Module im Laufe der Zeit zu publizieren. Erfahrungen aus den bereits durchgeführten Train-the-Trainer-Workshops sowie Rückmeldungen von Teilnehmenden sind in das Konzept eingeflossen. Diese fünfte, überarbeitete Version des Konzepts dient somit auch der weitergehenden Information der bereits geschulten Teilnehmenden. Darüber hinaus kann das Konzept (mit Anpassungen) für andere Zielgruppen wie z. B. Forschende adaptiert werden.
Learning Resource Type
Book, Course, Drill and Practice, Lesson Plan, Worksheet
File Format
PPTX, PDF, ZIP, DOCX, RTB, TEX, TXT, XLSX
Languages
German
Media Type
Presentation, Text
Publication Date
2023-12-14
License
CCBY
Size
100 MB
Authors
Keywords
#Forschungsdatenmanagement#Didaktik#Forschungsdaten#OER#Research data#Research data management#Schulung#Train-the-Trainer
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NFDI4Chem - Digitising Research Workflows in Chemistry
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NFDI4Chem - Digitising Research Workflows in ChemistryNFDI4Chem Vortrag von Dr. Nicole Jung und Dr. John Jolliffe über die Digitalisierung chemischer Forschungsarbeiten, vorgetragen bei den HeFDI Data Talks 2021.
File Format
PDF
Languages
English
Media Type
Presentation
Publication Date
2021-12-07
License
CCBY
Size
18 MB
Authors
Keywords
#NFDI#Forschungsdatenmanagement#NFDI4Chem#HeFDI#chemistry#HeFDI Data Talks#HeFDI Data Talks 2021#Hessische Forschungsdateninfrastrukturen#workflow
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FAIRagro - A FAIR Data Infrastructure for Agrosystems (proposal)
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FAIRagro - A FAIR Data Infrastructure for Agrosystems (proposal)This document is the proposal for the consortium FAIRagro in the framework of the National Research Data Infrastructure (NFDI) in Germany. The proposal was submitted to the German Research Foundation (DFG) in Nov 2021. The proposal was finally accepted with a revised working program in Feb 2023. All financial resources (personnel, material, direct project costs, in-kind contributions) were removed from the public version.n
File Format
PDF
Languages
English
Media Type
Text
Publication Date
2023-09-21
License
CCBY
Size
2.9 MB
Authors
Keywords
#NFDI#research data management#agrosystems#research data infrastructures
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DFG Practical Guidelines on Digitisation. Updated version 2022.
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DFG Practical Guidelines on Digitisation. Updated version 2022.The DFG Practical Guidelines on Digitisation provide a fundamental basis for DFG-funded digitisation projects in its “Digitisation and Indexing” programme: They formulate standards and contain information on organisational, methodological and technical issues in the context of digitising and indexing objects relevant for research. They thus make an important contribution towards the sustainability, accessibility and compatibility of funded projects and to the resulting infrastructure. This document is an updated version of the Practical Guidelines last published in 2016 by the DFG. It was developed in consultation with the DFG Head Office by a group of authors initiated by the NFDI consortium NFDI4Culture, the majority of whose members have long played a part in shaping the Practical Guidelines and are actively involved in the NFDI consortia NFDI4Culture, NFDI4Memory, NFDI4Objects and Text+. The now revised Practical Guidelines on Digitisation serve as starting point for a material- and community-related differentiation of the Practical Guidelines by the communities. All communities and institutions concerned with the digitisation of research-relevant objects are encouraged to contribute their expertise to the further process.
Learning Resource Type
Report
File Format
PDF
Languages
English
Media Type
Text
Publication Date
2023
License
CCBY
Size
820 KB
Authors
Keywords
#NFDI#metadata#National Research Data Infrastructure#cataloging#digitization#information infrastructure#standardization
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NFDI ToolTalk: One roof, several services: Bringing together all DataPLANT efforts
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NFDI ToolTalk: One roof, several services: Bringing together all DataPLANT effortsDescription Slides of the presentation given on June 08, 2022 as part of the NFDI ToolTalk series. The presentation follows up on the status reached after one and a half year into DataPLANT services discussions and developments. It will show the general concept and the already implemented services and how they could fit into either local or centralized research infrastructures. In the future these services may run on-top of future NFDI base services or integrate NFDI base service components like AAI. DataPLANT services might as well be offered to a wider community beyond fundamental plant research.
File Format
PDF
Languages
English
Media Type
Presentation
Publication Date
2022-06-08
License
CCBY
Size
1.8 MB
Authors
Keywords
#Research Data Management#NFDI#DataPLANT#nfdi4plants#Nationale Forschungsdateninfrastruktur#Open Science#RDM service infrastructure#Software Sustainability#ToolTalk
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Data
Literacy
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